Laurent Debrot, doyen du Grand Conseil et président du comité d'initiative, se dit déçu du refus de l'exécutif. Il juge le contre-projet insatisfaisant, mais se console en remarquant que l'Etat montre au moins une volonté d'améliorer l'attractivité des transports en commun. Laurent Favre, chef du département du développement territorial et de l'environnement, insiste sur les coûts importants qu'impliqueraient la gratuité, et sur l'image négative que cela engendrerait auprès de la Confédération et des autres cantons, à l'heure où Neuchâtel profite déjà d'un important fonds fédéral pour le RER.